Maarten Jansen kreeg vanaf zijn negende cellolessen. Zijn docenten waren achtereenvolgens Jet van Baaren, Lenian Benjamins, Elias Arizcuren, Claus Kanngießer, Philippe Muller en Christoph Henkel. Als solist speelde Maarten de concerten van Haydn, Ibert, Tartini, Couperin, Schumann, Saint-Saëns en Elgar. Ook heeft hij Kol Nidrei van Max Bruch, het Tripelkonzert van Beethoven en het Dubbelconcert van Brahms op zijn repertoire.
Maarten Jansen speelt kamermuziek met Trio Arpa Aul'Arco, Ensemble Oostenrijk-Jansen, het Daidalos pianotrio en met pianist Bas Verheijden. Verder speelde hij bij het Kammermusikfest für Preisträger des ARD-Wettbewerbs, Spectrum-Concerts Berlin en bij het Internationaal Kamermuziekfestival Utrecht.
Maarten werkte als solocellist voor het Münchener Kammerorchester, het Tonkünstler Orchester in Wenen, het Noord Nederlands Orkest en het Metropole Orkest. Sinds 2007 speelt mee in de cellogroep van het Metropole. Op de cd De Vier Jaargetijden van Janine Jansen is Maarten te horen als cellist van het ensemble.